In nij wapen foar tuberkuloaze-diagnoaze en deteksje fan medisynresistinsje: in nije generaasje rjochte sekwinsje (tNGS) kombineare mei masinelearen foar diagnoaze fan tuberkuloaze-hypersensitiviteit
Literatuerrapport: CCa: in diagnostysk model basearre op tNGS en masinelearen, dat geskikt is foar minsken mei minder baktearjele tuberkuloaze en tuberkuloaze meningitis.
Titel fan it proefskrift: Tuberkuloaze-rjochte folgjende-generaasje sekwinsjearring en masinelearen: in ultra-gefoelige diagnostykstrategy foar pausifike pulmonale tubularen en tubulêre meningitis.
Periodyk: 《Clinica Chimica Acta》
AS: 6.5
Datum fan publikaasje: jannewaris 2024
Yn kombinaasje mei de Universiteit fan 'e Sineeske Akademy fan Wittenskippen en it Beijing Chest Hospital fan 'e Capital Medical University hat Macro & Micro-Test in tuberkuloaze-diagnoazemodel ûntwikkele basearre op 'e nije generaasje fan targeted sequencing (tNGS) technology en masinelearmetoade, dy't in ultrahege deteksjegefoelichheid levere foar tuberkuloaze mei in pear baktearjes en tuberkuloaze meningitis, in nije metoade foar hypersensitiviteitsdiagnoaze levere foar de klinyske diagnoaze fan twa soarten tuberkuloaze, en holpen hat mei de krekte diagnoaze, it opspoaren fan medisynresistinsje en de behanneling fan tuberkuloaze. Tagelyk is fûn dat it plasma-cfDNA fan 'e pasjint brûkt wurde kin as in geskikt stekproeftype foar klinyske sampling by de diagnoaze fan TBM.
Yn dizze stúdzje waarden 227 plasmamonsters en harsenfloeistofmonsters brûkt om twa klinyske kohorten fêst te stellen, wêryn't de laboratoariumdiagnostyske kohortmonsters brûkt waarden om it masinelearenmodel foar tuberkuloaze-diagnoaze fêst te stellen, en de klinyske diagnostyske kohortmonsters waarden brûkt om it fêststelde diagnostykmodel te ferifiearjen. Alle monsters waarden earst as doelwyt brûkt troch in spesjaal ûntworpen, rjochte fangeprobepool foar Mycobacterium tuberculosis. Dêrnei, basearre op TB-tNGS-sekwinsjegegevens, wurdt it beslútbeammodel brûkt om 5-fâldige krúsfalidaasje út te fieren op 'e trainings- en falidaasjesets fan' e laboratoariumdiagnostyske wachtrige, en wurde de diagnostykdrempels fan plasmamonsters en harsenfloeistofmonsters krigen. De krigen drompel wurdt yn twa testsets fan 'e klinyske diagnoazewachtrige brocht foar deteksje, en de diagnostykprestaasjes fan' e learling wurde evaluearre troch de ROC-kromme. Uteinlik waard it diagnoazemodel fan tuberkuloaze krigen.
Fig. 1 skematysk diagram fan ûndersyksûntwerp
Resultaten: Neffens de spesifike drompelwearden fan CSF DNA-monsters (AUC = 0.974) en plasma cfDNA-monsters (AUC = 0.908) bepaald yn dizze stúdzje, wie ûnder 227 samples de gefoelichheid fan 'e CSF-monster 97.01%, de spesifisiteit wie 95.65%, en de gefoelichheid en spesifisiteit fan 'e plasma-monster wiene 82.61% en 86.36%. Yn 'e analyze fan 44 pear samples fan plasma cfDNA en cerebrospinale floeistof DNA fan TBM-pasjinten, hat de diagnostyske strategy fan dizze stúdzje in hege konsistinsje fan 90.91% (40/44) yn plasma cfDNA en cerebrospinale floeistof DNA, en de gefoelichheid is 95.45% (42/44). By bern mei longtuberkuloaze is de diagnostyske strategy fan dizze stúdzje gefoeliger foar plasma-monsters as de Xpert-deteksjeresultaten fan maagsapmonsters fan deselde pasjinten (28.57% VS 15.38%).
Fig. 2 Analyseprestaasjes fan tuberkulose-diagnoazemodel foar populaasjesteekproeven