In nij wapen foar Tuberkulosis-deteksje fan tuberkuloaze en drugsfetsingsbesitting: in nije generaasje-rjochte sequencing (TNGS) kombineare mei masjine-learen foar diagnoaze foar tuberkuliseare
Literature Report: CCA: in diagnostysk model basearre op TNGS- en masine learen, wat geskikt is foar minsken mei minder baktearkulkuloaze en tuberkulêre meningitis.
Thesis Titel: Tusterculous-rjochte folgjende generaasje Sequencing en Masine Learning: in ultra-gefoelige diagnostyske strategy foar paumon-pulmonêre buis en tubulêre meningitis.
Periodyk: "Clinica-chimica acta"
As: 6.5
Datum fan publikaasje: jannewaris 2024
Kombineare mei de Universiteit fan Sineeske Akademy fan Wittenskippen en Peking Chosces fan Hadhercital fan MACROS-medyske universiteit, basearre op 'e nije generaasje fan doelgroepen (TNG's) Technology en Magon Learning Metoade levere, dy't Ultra-heech levere detection gefoelichheid foar tuberkuloaze mei pear baktearjes en tuberkulêre meningitis, levere in metoade foar diagnoaze fan in nije hypersensitiviteit foar de klinyske diagnoaze fan twa soarten tuberkuloaze, en holpen de krekte diagnoaze, drugsfetsingsdeteksje en behanneling fan tuberkuloaze. Tagelyk wurdt fûn, wurdt it te finen dat de Patient's PLASMA CFDNA kin brûkt wurde as in gaadlik foarbyldtype foar klinyske sampling yn 'e diagnoaze fan TBM.
Yn dizze stúdzje waarden 227 plasma-samples en senbroeplofte-samples brûkt om te fêstigjen om twa klinyske kohorten te fêstigjen dat de samplos fan 'e masjine-diagnoaze waarden oprjochte, en de klinyske diagnoaze koenen samples waarden brûkt om te ferifiearjen Diagnostysk model. Alle samples waarden earst rjochte troch in spesjaal ûntworpende doelpunt-sonde-swimbad foar mycobacterium tuberkuloaze. Doe, basearre op TB-TND-sequencing gegevens, wurdt it beslútbeammodel brûkt om 5-fold-krúsidaasje út te fieren op 'e opliedings en de diagnostyske drank fan plasma-samples en cerebrospinale floeistofbliuwe. De krige drompel wurdt yn twa testsets brocht brocht fan klinyske diagnoaze ynljochting, en de diagnostyske prestaasjes fan 'e learling wurdt evalueare troch ROC-kromme. Uteinlik waard it houlikmodel fan tuberkuloaze krigen.
Fig. 1 skematysk diagram fan ûndersyksûntwerp
Resultaten: Neffens de spesifike drompels fan CSF DNA Sample (AUC = 0,974) en plasma CFDna-sample wie yn dizze saken fan CSF-sample 97,01%, de spesifisiteit wie 95,65%, en De gefoelichheid en spesifisiteit fan plasma-stekproef wie 82,61% en 86,36%. Yn 'e analyze fan 44 poppeste foarbylden fan plasma CFDNA en cerebrospinale floeistof DNA fan TBM-pasjint fan 90,91) yn plasma CFDNA en cerebrospinale floeistof DNA, en de gefoelichheid is 95,45% (42/44). By bern mei pulmonale tuberkuloaze is de diagnostyske strategy mear gefoelich foar plasma-samples dan de Xpert-detroversen fan Gastryske sop-samples fan deselde pasjinten (28,57% vs 15.38%).
Fig. 2 Aanefering prestaasjes fan Tubergulosis Diagose-model foar populaasjemonsters
Fig. 3 Diagnostyske resultaten fan pareare foarbylden
Konklúzje: In hypersensitive metoade foar tuberkuloaze waard oprjochte yn dizze stúdzje, dy't in diagnostysk ark kin leverje mei de heechste detexensitiviteit foar klinyske pasjinten mei oligobakslike tuberkuloaze (negative kultuer). Deteksje fan hypersensitive tuberkuloaze basearre op plasma CFDNA kin in gaadlik stekproef wêze foar de aktive tuberkuloaze en krasma-monsters te sammeljen dan opbringstfloeistof foar pasjinten te sammeljen dan cerebrospinale floeistof foar pasjinten te sammeljen).
Orizjinele LINK: https://www.sciencedirect.com/cience/artikel/pii/S000989898123004990? Fia% 3DiBub
Koarte yntroduksje fan Macro & Magro-Test Tuberculose Series Detekment Products
Mei it each op 'e yngewikkelde sampituaasje fan' e oandielen fan tuberkuloaze en ferskate behoeften, biedt makro en mikro en mikro-test foar vloechkundige foarbylden fan sputum-samples, kwalykbiblioteek en sequencing, en gegevens analyse. De produkten dekke rappe diagnoaze fan tuberkuloaze pasjinten, drugs ferset fan tuberkuloaze, typ foar myncobacesium tuberkuloaze fan diagersyksitiviteit fan baktearjes - negative tuberkuloaze en tuberkulêr minsken, ensfh.
Seriële deteksje Kits foar tuberkuloaze en mycobakensia:
| Item nee | Produkt Namme | Produkt testenynhâld | foarbyldtype | Tapasse model |
| HWTS-3012 | SAMPLE RELEASE AGENT | Wurdt brûkt yn 'e liquefaction behanneling fan Sputum-samples, hat in earste klasse Recordnûmer krigen, Sutong Masines Equipment 20230047. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | QualComm Quantity-detectie Kit foar hypersensitive tuberkuloaze (sonde capto metoade) | Net-ynkringende (floeibere biopsie) Hypersensitiviteitsdeteksje foar baktearjes - negative pulmonêre tuberkuloaze en hardnodulen; De foarbylden fan minsken fertochten wurde besmet mei tuberkuloaze as net-tuberkuloaze waarden analysearre troch meteachsjelimen fan tuberculoaze of de wichtichste esto-ferset tsjin mycobacterium tuberkuloaze waarden levere. | Perifeare bloed, alveolêre lavage floeistof, hydrothorax en ascites, fokus punkterpotten, cerebrospinale floeistof. | Twadde generaasje |
| HWTS-NGS-T001 | MyCobacterium Typing- en drugsfetsingsdetekenskit (Multiplex Amplicificification Sawating metoade) | MyCobacterium typtest, ynklusyf MTBC en 187 NTM;Deteksje fan medikaasjebesitting fan MyCobacterium Tuberculosydt beslacht 13 drugs en 16 kearn mutaasje fan drugs en 16 kearn mutaasje fan genêzen fan drugsfetsettings. | Sputum, alveolêre lavage floeistof, hydrothorax en ascites, fokus Puncture sample, opbringst, opbringst, cerebrospinale floeistof. | Twadde / tredde generaasje dual platfoarm |
Hichtepunten: HWTS-NGS-T001 MyCobacterium Typing- en drugsfetsingsdeteksje Kit (MultiLeks-amplifikaasje metoade)
Produkt Yntroduksje
It produkt is basearre op 'e wichtichste-en twadde-line-drugs beskreaun yn' e WIE TB-Rjochtlinen, Macrillycosiden, en de Untfangingssidens, en de drugsbesittingen Alle ien groep fan drugsbesitting-relatearre siden yn 'e NTM-behanneling Dy't mycobacterium Tuberculosis Complex-katalogus: Lykas oare rapporteare drugsresistinsje genen en mutaasje-siden neffens it ûndersyk en statistiken fan Hege-skoare literatuer thús en yn it bûtenlân.
Ynstjoering fan 'e NTM is basearre op de NTM-straffen gearfette yn' e NTM-rjochtlinen publisearre troch Sineesk tydskrift fan tuberkuloaze en sykheljende sykten en de konsensus fan saakkundigen. De ûntwurpen typenprimers kinne ôfmakke, folchoarder en annulearje mear dan 190 NTM-soarten.
Troch doelen MultiLex PCR-amplication Technology en drugs-resistinte genen fan MYCOBACIERIUM waarden fersterke troch multiplex PCR, en de heechpokomskombinaasje fan doel genaëren te wurde ûntdutsen waard krigen. De Amplifieare produkten kinne wurde oanlein yn twadde-generaasje as tredde-generaasje heechweardige libraren, en alle twadde-generaasje en tredde-generaasje-optrede platfoarm wurde ûnderwurpen om de sekwinsje-ynformaasje te krijen om de sekwinsje-ynformaasje te krijen. Troch te ferlykjen mei de bekende mutaasjes befette yn 'e ynboude referinsjoneel kompensaasje fan MYCOBACERSE TUBERCULOSE TOEMPTEN TO FERGESE VERJOCHTEN OAN FERGESE VERJOCHTEN OF MUTBIESKING OF MUTICEBIESS FAN DIRMERKULOSISEN OM THE-TUBERCULOSISEN OM THE-TUBERCULOSISEN OAN TUBERCULISEMENDE THUMBERSKULDEN FAN BINNE BINNE. Kombineare mei it sels iepene sputum-sample-behanneling fan makro en mikroyske soere amplifikaasje fan klinyske sputum as dy fan tradisjonele metoaden) waard oplost, sadat de drugsfetsingsdeteksje kin wêze direkt oanfrege by klinyske sputum-samples.
Produktdeteksjeberik
34drugsresistinsje-relatearre gena's fan18Anti-tuberkulose drugs en6NTM drugs waarden ûntdutsen, dekking297drugsresitânsje siden; Tsien soarten mycobacterium tuberkuloaze en mear dan190soarten NTM waarden ûntdutsen.
Tabel 1: Ynformaasje fan 18 + 6 Drugs + 190 + NTM
Produkt foardiel
Sterke klinyske oanpasberens: De sputum-samples kinne direkt wurde ûntdutsen mei selsbliuwe autorisaasje sûnder kultuer.
De eksperimintele operaasje is ienfâldich: de earste ronde fan amplifikaasje-operaasje is ienfâldich, en de biblioteekop is foltôge yn 3 oeren, dy't it wurk-effisjinsje foltôge is.
Wjerstân foar útbetelling en drugsbesitting: it dekking fan it typen- en drugsresitânsje fan MTB, dy't de wichtige punten binne, krekte fersoargingde deteksje, stypje unôfhinklike analyse software, en generearje analyse rapportearje mei ien klik.
Kompatibiliteit: Produkt kompatibiliteit, oanpasse oan mainstream-ilm en MGI / ONT-platfoarms.
Produkt spesifikaasje
| Produktkoade | Produkt Namme | Detection Platform | Spesifikaasjes |
| HWTS-NGS-T001 | MyCobacterium Typing- en drugsfetsingsdeteksje Kit (Multimex-amplifikaasje metoade) | Ont illumina, mgi, salus pro | 16/96RXN |
Posttiid: jan-23-2024