In resinte stúdzje publisearre ynMikrobioomfierde virale metagenomyske analyze út op 846 wylde lytse sûchdieren - ynklusyf flearmûzen, knaagdieren en spitsmuizen - sammele yn Sierra Leone, West-Afrika. De stúdzje identifisearre yn totaal 39 sûchdier-assosjeare RNA-firussen, besteande út 26 nije en 13 earder bekende firussen. Hjirûnder liet de Paramyxoviridae-famylje de heechste ferskaat sjen, wylst knaagdieren it grutste oantal firale soarten befette (n = 26).
Soönotyske risikobeoardieling liet trije bekende soönotyske firussen sjen - encefalomyocarditisfirus, Lassafirus, en Rocahepevirus sp. - lykas trije firussen mei potinsjeel spilloverrisiko: Melianfirus, knaagdierhepatitisfirus, en Hunnivirus A. Opmerklik is dat ûnder de nij identifisearre firussen Bat ledantevirus 2 de tichtste fylogenetyske relaasje mei it minsklik-ynfektearjende Le Dantec-firus sjen liet. Serologyske analyze ûntduts fierder neutralisearjende antistoffen tsjin dit firus by 2,8% fan 'e pleatslike ynwenners, wat suggerearret dat der eardere, wierskynlik net-ûntdutsen, minsklike bleatstelling is.
Dizze befiningen markearje de oanwêzigens fan in substansjeel, troch knaagdieren dominearre, firusreservoir yn West-Afrika en ûnderstreekje it krúsjale belang fan yntegreare tafersjochstrategyen op 'e ynterface tusken minske en bist. It kombinearjen fan metagenomyske screening mei serologyske falidaasje biedt in robúst ramt foar it identifisearjen fan firussen mei zoönoatysk en spilloverpotinsjeel.
Yn it ôfrûne desennium is mear as 60% fan 'e opkommende ynfeksjesykten by minsken ûntstien út reservoirs fan dieren, wêrby't flearmûzen, knaagdieren en spitsmuizen erkend wurde as wichtige gastheren fan zoönotyske firussen. Afrika wurdt breed beskôge as in hotspot foar zoönotyske sykten. Bygelyks, Sierra Leone rapportearre mear as 28.000 gefallen tidens de Ebola-útbraak fan 2014-2016.
Nettsjinsteande de wichtige lêst fan zoönotyske sykten yn dizze regio, bliuwe de ferskaat en fersprieding fan firussen yn wylde lytse sûchdieren ûnfoldwaande karakterisearre. Om dizze tekoart oan te pakken, fierden ûndersikers in systematyske virome-analyze út fan 846 wylde lytse sûchdieren dy't tusken 2018 en 2023 op trije lokaasjes yn Sierra Leöane fongen binne. De stúdzje hie as doel de ferskaat oan firussen te karakterisearjen, kandidaten te identifisearjen mei potinsjeel foar oerdracht tusken soarten, zoönotyske risiko's te beoardieljen en bewiis te generearjen om warskôgingssystemen foar opkommende ynfeksjesykten te stypjen.
Kearnmetoaden
De stúdzje paste in wiidweidige workflow foar virale metagenomika ta:
- Foarbyldferwurking:Hart-, lever-, milt-, long- en nierweefsels waarden sammele, gearfoege, homogenisearre en ûnderwurpen oan totale RNA-ekstraksje.
- Sekwinsje en gearstalling:Ribosomaal RNA-depleasje waard útfierd foarôfgeand oan de konstruksje fan 'e bibleteek, folge troch hege-trochput-sekwinsjearring mei it Illumina NovaSeq 6000-platfoarm. Firale contigs waarden de novo gearstald.
- Firusidentifikaasje:Firussen waarden identifisearre op basis fan RNA-ôfhinklike RNA-polymerase (RdRp) genôfstimming. Allinnich firussen assosjeare mei vertebraten waarden bewarre, útsein baktearjele, skimmel- en plantefirussen.
- Bioinformatyske analyze:Fylogenetyske rekonstruksje, rekombinaasje-analyze, modellering fan oerdrachtnetwurken tusken soarten, en zoönotyske risikobeoardieling waarden útfierd.
- Serologyske falidaasje:In op VSV basearre pseudovirusneutralisaasje-assay waard ûntwikkele foar Bat ledantevirus 2. Neutralisearjende antistoffen waarden ûntdutsen yn 2,8% fan minsklike sera, wat bewiis leveret fan potinsjele zoönotyske oerdracht.
StudearjeResultaten
1. Virale ûntdekking en ferskaat
Dizze stúdzje fierde transkriptomyske sekwinsjeanalyse út op 846 wylde bisten dy't yn Sierra Leone sammele binne, ynklusyf knaagdieren, flearmûzen en spitsmuizen. Op basis fan folsleine RNA-ôfhinklike RNA-polymerase (RdRp) gensekwinsjes waarden yn totaal 39 sûchdier-assosjeare RNA-firussen identifisearre, besteande út 13 earder bekende firussen en 26 nije firussen.
Wat de firale gearstalling oanbelanget, liet de famylje Paramyxoviridae it heechste nivo fan ferskaat sjen oer alle trije gasthearoarders, folge troch Astroviridae en Picornaviridae. Wat de gasthearferdieling oanbelanget, droegen knaagdieren de grutste firale ferskaat by, mei yn totaal 26 firussoarten, wat oanjout dat se in promininte rol hawwe as reservoirs fan firale ferskaat yn 'e regio.
2. Soönotysk risiko
Soönotyske risikobeoardieling identifisearre trije bekende soönotyske firussen: encefalomyokarditisfirus, Lassafirus en Rocahepevirussoarten. Derneist waarden trije firussen - Melianfirus, knaagdierhepatitisfirus en Hunnivirus A - identifisearre as mei in potinsjeel spilloverrisiko.
Under de 26 nij ûntdutsen firussen waarden fjouwer foarsein in hege zoönotyske potinsje te hawwen op basis fan fylogenetyske en genomyske skaaimerken. Benammen Bat ledantevirus 2 liet de tichtste fylogenetyske relaasje sjen mei it bekende minsklik-ynfektearjende Le Dantec-firus.
Folgjend serologysk ûndersyk stipe dizze fynst fierder, om't neutralisearjende antistoffen tsjin Bat ledantevirus 2 waarden ûntdutsen yn 2,8% fan 'e sera fan pleatslike ynwenners. Dit resultaat suggerearret dat net-erkende of asymptomatyske ynfeksjes miskien al foarkommen binne binnen de minsklike befolking, wat in potinsjeel mar earder net-erkende zoönotyske oerdrachtpaad oanjout.
3. Dynamyk fan oerdracht tusken soarten
Analyse fan oerdracht tusken soarten liet sjen dat knaagdieren in sintrale posysje ynnimme binnen it firale dielingsnetwurk, en fungearje as wichtige knooppunten dy't firale útwikseling tusken gasthearsoarten fasilitearje. Yn totaal waarden 15 firussen identifisearre as hawwende de mooglikheid foar oerdracht tusken soarten.
Fierdere analyze fan oerdrachtpatroanen tusken oarders joech oan dat firale dielen faker foarkaam tusken gastheren binnen deselde taksonomyske oarder, wat suggerearret dat gasthearre-relatearre relaasje in wichtige rol spilet yn 'e oerdrachtdynamyk. Yn tsjinstelling, lieten flearmûzen in relatyf legere kapasiteit foar oerdracht tusken oarders sjen.
Wichtich is dat bewiis fan útwreiding fan it gasthearberik waarnommen waard yn bepaalde firussen. Bygelyks, it Melian-firus, dat earder spesifyk beskôge waard foar spitsmuizen, waard ek ûntdutsen yn knaagdieren yn dizze stúdzje, wat in potinsjele ferskowing yn oanpassingsfermogen fan 'e gasthear en in ferhege risiko op bredere oerdracht oanjout.
Konklúzjes en gefolgen foar folkssûnens
- Hege viromeferskaat yn wylde lytse sûchdieren:De ûntdekking fan 39 RNA-firussen, wêrûnder 26 nije soarten, lit in grut firusreservoir yn 'e regio sjen en rapportearret foar it earst nije firussen mei in hege zoönotyske potinsje (bygelyks, Bat ledantevirus 2).
- Knaagdieren as prioriteitsdoelen foar tafersjoch:Knaagdieren fungearje as wichtige knooppunten foar firale oerdracht en drage de heechste firale ferskaat, wat it grutste risiko op spillover fertsjintwurdiget.
- Needsaak foar yntegreare tafersjochstrategyen:De befiningen stypje it prioritearjen fan knaagdieren yn aktive tafersjochprogramma's en it ymplementearjen fan yntegreare oanpakken dy't metagenomika, serology en ekologyske monitoring kombinearje op ynterfaces tusken minske en wylde dieren.
Oer it algemien leveret dizze stúdzje kritysk bewiis om systemen foar iere warskôging en risikobeoardielingskaders foar opkommende zoönotyske sykten te stypjen, en fersterket it belang fan proaktive tafersjoch yn regio's mei hege risiko's.
Produktynformaasje
Pleatsingstiid: 23 maart 2026