In resinte metagenomyske stúdzje hat in opmerklik ferskaat spektrum fan firussen en baktearjes oan it ljocht brocht dy't troch knaagdieren yn 'e provinsje Heilongjiang droegen wurde, ynklusyf it Lassa-firus, Amoer-firus, Salmonella en Yersinia pestis.
It ûndersyk brûkte dePatogen RNA-ferrikingskit fan Macro & Micro-Test, basearre op probe-fangsttechnology. Troch selektyf it útputten fan gasthear-rRNA en oare konservearre gasthearfragminen, bewarre de metoade effektyf mikrobieel RNA, wêrtroch't de gefoelichheid foar it opspoaren fan patogenen signifikant ferbettere waard. Dizze stap foar it ferriken fan patogen-RNA wie kritysk foar it berikken fan in hege deteksjesnelheid en levere sterke technyske stipe foar it tafersjoch op patogenen.
Knaagdieren: Wichtige reservoirs fan zoönotyske sykten
Knaagdieren binne de soarterykste en wiidst fersprate groep sûchdieren, dy't mear as 2.000 soarten wrâldwiid omfetsje en mear as 40% fan alle sûchdiersoarten útmeitsje.
Neist har ekologyske belang tsjinje knaagdieren as wichtige reservoirs en fektoren fan ferskate zoönotyske patogenen.Omdat knaagdierhabitats faak oerlaapje mei minsklike omjouwings - troch direkte biten, kontakt mei útskieding, of yndirekte oerdracht fia fleagen en miggen - foarmje de patogenen dy't se herbergje oanhâldende bedrigingen foar de folkssûnens.
It is opmerklik dat mear as 70% fan opkommende ynfeksjesykten ûntsteane by wylde dieren, wêrby't knaagdieren ien fan 'e wichtichste firale reservoirs foarmje.
Grinsregio Heilongjiang: In frontline foar patogenenbewaking
Heilongjiang, in grinsprovinsje yn noardeastlik Sina, hat in oerfloed oan ekologyske boarnen en dielt grinzen mei meardere lannen. De kombinaasje fan rike biodiversiteit en faak grinsferskuiwingen skept geunstige omstannichheden foar de oerdracht fan patogenen.
Tusken juny en july 2021 hawwe ûndersikers 67 wylde knaagdieren sammele út Hengdaohezi Town, Mudanjiang City. De samples omfette:
l20Apodemus-skiereilân
l47Myodes rufocanus
Alle eksimplaren waarden fongen yn wenwiken en omlizzende lânbougrûn, wat de nauwe ynterface tusken minsklike delsettings en wylde dierenhabitats markearret.
Patogenferrikingstechnology: Oerwinnen fan gasthearachtergrûnynterferinsje
Yn metagenomyske sekwinsjering domineart host-RNA typysk sekwinsjearringslêzingen, wêrtroch't patogeensignalen mei lege oerfloed maskearre wurde.
Om dizze útdaging oan te pakken, brûkte de stúdzjeMacro & Micro-Test's patogenmetagenomyske deteksjekit. Mei help fan probe-capture-technology bine spesifyk ûntworpen probes oan gasthear-rRNA en konservearre sekwinsjes, wêrtroch't har útputting mooglik is en dêrmei mikrobieel RNA ferrike wurdt.
Dizze oanpak ferbettere de gefoelichheid foar it opspoaren fan patogenen substansjeel, wêrtroch't downstream-sekwinsje in heger persintaazje patogenlêzingen weromfûn wurde koe. De ferrikingsstap lei in solide basis foar it krekt karakterisearjen fan it patogenspektrum dat troch knaagdieren droegen wurdt.
Nei ferriking ûndergien RNA-samples reverse transkripsje, bibleteekkonstruksje en hege-trochput sekwinsje. Bioinformatyske analyze omfette:
l Filterjen fan it gastheargenoom
l Taksonomyske klassifikaasje mei help fan Kraken2
l Oerfloedskorreksje mei Bracken
Dizze workflow generearre in wiidweidich profyl fan firale en baktearjele mienskippen.
Undersyksresultaten: Ko-sirkulaasje fan meardere firussen en baktearjes
Virale befiningen
De ûntdutsen firussen hearden ta 21 firale famyljes, ynklusyfArenaviridaeenHantaviridae.
Trochnijgearstalling mei Megahit waarden 154 firale contigs generearre, wêrfan 110 oerienkamen mei 19 firussen út acht famyljes.
In Apodemus-skiereilân, waarden de folgjende firussen identifisearre:
l Arenaviruses: Lassa firus, Wenzhou firus, Gairo firus
l Hantaviruses: Amur firus, Puumala firus
In Myodes rufocanus, Rattearterivirus en Amoerfirus waarden ûntdutsen.
Under dizze patogenen:
It Lassa-firus is in feroarsaakjende agint fan firale hemorragyske koarts, mei in mortaliteit fan sawat 20%.
It Amoerfirus is ien fan 'e patogenen dy't ferantwurdlik binne foar hemorragyske koarts mei niersyndroom (HFRS). Sina rapportearret de heechste wrâldwide lêst fan hantavirusynfeksjes.
Bakteriële befiningen
In totaal fan 1.051 baktearjeslachten waarden annotearre.
De meast foarkommende geslachten wiene:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellais in wichtige troch iten oerdroegen patogeen, ferantwurdlik foar nei skatting 9 miljoen gefallen fan tyfus en sawat 110.000 deaden jierliks wrâldwiid.
Yersinia pestis, de feroarsaakjende agint fan 'e pest, is ferantwurdlik west foar trije histoaryske pandemyen. De provinsje Heilongjiang wurdt erkend as ien fan 'e natuerlike pestplakken fan Sina en bliuwt in prioriteitsregio foar pestbewaking.
Betekenis fan 'e stúdzje
Wittenskiplike bydragen
Dizze stúdzje fertsjintwurdiget it earste rapport fan Lassa-firusfragminen en rattearteritisfirus by knaagdieren út Heilongjiang, en wreidet de Sina-database mei troch knaagdieren oerbrochte patogenen út.
It karakterisearret systematysk firale en baktearjele mienskippen yn lokale knaagdierpopulaasjes, en leveret basisgegevens foar tafersjoch op zoönotyske sykten yn grinsregio's.
Ymplikaasjes foar folkssûnens
De befiningen ûnderstreekje de needsaak foar trochgeande tafersjoch en screening fan patogenen fanA. peninsulaeenM. rufocanus.
De gegevens leverje wittenskiplik bewiis dat strategyen foar boarnekontrôle stipet foar sykten lykas pest en hemorragyske koarts mei niersyndroom.
Metodologyske Sterktes
Metagenomyske sekwinsjering makket ûnpartidige deteksje fan sawol bekende as nije patogenen mooglik.
Yn dizze stúdzje liet de technology foar it ferriken fan patogenen fan Macro & Micro-Test sterke prestaasjes sjen, wêrtroch't de deteksje fan doelpatogenen yn komplekse biologyske samples effektyf ferbettere wurdt. De resultaten befêstigje de mooglikheid om de identifikaasje fan patogenen mei hege gefoelichheid te stypjen by it tafersjoch op wylde dieren.
Produktoanbefelling
Op basis fan syn suksesfolle tapassing yn dizze stúdzje, wurdt de Macro & Micro-Test Pathogen RNA Enrichment Kit tige oanrikkemandearre foar metagenomysk tafersjochûndersyk.
Troch it effisjint útputten fan nukleïnesoeren fan 'e gasthear en it ferriken fan mikrobiële sekwinsjes, ferbetteret de kit de gefoelichheid foar deteksje en gegevenskwaliteit signifikant. It is in essinsjeel ark foar krekte ûntdekking fan patogenen yn komplekse samples en biedt robúste technyske stipe foar tafersjoch op folkssûnens, beoardieling fan zoönotyske risiko's en tarieding op útbraken.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Pleatsingstiid: 2 maart 2026